בתקופת המנדט קבעו הבריטים את בית הכלא המרכזי שלהם בצפון הארץ, במצודת העיר. בבית-כלא ידוע לשמצה זה נכלאו מאות מחברי ארגוני המחתרות ה"הגנה", האצ"ל והלח"י, אשר נאסרו בשל מאבקם על הגנת היישוב, מלחמתם בשלטון המנדטורי ועל זכותם להקמת בית לאומי בארץ-ישראל.

במאי 1947 נפרץ כלא עכו ע"י לוחמי האצ"ל, במבצע שהדהים בתעוזתו. המוזיאון מציג את אורח חיי האסירים בכלא ופורש את סיפור הפריצה לכלא באמצעות חזיון אור-קולי. חדרי ההנצחה באתר מוקדשים לתשעת הנופלים בפריצה ולתשעת הרוגי המלכות אשר נתלו בתא הגרדום שבכלא.